AT5G03170.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:extracellular 1.000 ASURE: extracellular What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : FASCICLIN-like arabinogalactan-protein 11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
FASCICLIN-like arabinogalactan-protein 11 (FLA11); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: FAS1 domain (InterPro:IPR000782); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: FASCICLIN-like arabinogalactan-protein 12 (TAIR:AT5G60490.1); Has 965 Blast hits to 948 proteins in 162 species: Archae - 18; Bacteria - 233; Metazoa - 22; Fungi - 18; Plants - 634; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 40 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:-:752898..753638 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 25593.10 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.84 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.05 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 246 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MATSRTFIFS NLFIFFLVIA TTYGQAPAPG PSGPTNITAI LEKAGQFTLF IRLLKSTQAS DQINTQLNSS SSNGLTVFAP TDNAFNSLKS GTLNSLSDQQ 101: KVQLVQFHVL PTLITMPQFQ TVSNPLRTQA GDGQNGKFPL NITSSGNQVN ITTGVVSATV ANSVYSDKQL AVYQVDQVLL PLAMFGSSVA PAPAPEKGGS 201: VSKGSASGGD DGGDSTDSSD AERTGFGFGI RITTVAAIAA SSSLWI |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)