AT5G02380.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.845 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : metallothionein 2B | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
cysteine-rich protein with copper-binding activity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
metallothionein 2B (MT2B); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Plant metallothionein, family 15 (InterPro:IPR000347); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: metallothionein 2A (TAIR:AT3G09390.1); Has 601 Blast hits to 601 proteins in 129 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 21; Fungi - 0; Plants - 576; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 4 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:-:506755..507164 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 7766.13 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 4.54 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.19 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 77 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
1: MSCCGGSCGC GSACKCGNGC GGCKRYPDLE NTATETLVLG VAPAMNSQYE ASGETFVAEN DACKCGSDCK CNPCTCK | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)