AT5G02120.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 ASURE: plastid What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : one helix protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a one helix protein homologous to cyanobacterial high-light inducible proteins. The protein is localized to the thylakoid membrane and its transcript is transiently induced by exposure to high light conditions. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
one helix protein (OHP); FUNCTIONS IN: molecular_function unknown; INVOLVED IN: response to high light intensity; LOCATED IN: chloroplast thylakoid membrane, chloroplast; EXPRESSED IN: 21 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; Has 58 Blast hits to 58 proteins in 21 species: Archae - 0; Bacteria - 4; Metazoa - 0; Fungi - 0; Plants - 47; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 7 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:+:419144..419633 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 12010.90 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 10.14 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.19 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 110 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MSSSPLSSSL FHPLSTLSTH CHGRRQNLCF NRKQQPFVVR AAKLPEGVIV PKAQPKSQPA FLGFTQTAEI WNSRACMIGL IGTFIVELIL NKGILELIGV 101: EIGKGLDLPL |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)