AT4G40010.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.849 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : SNF1-related protein kinase 2.7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
encodes a member of SNF1-related protein kinases (SnRK2) whose activity is activated by ionic (salt) and non-ionic (mannitol) osmotic stress. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
SNF1-related protein kinase 2.7 (SNRK2.7); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein kinase, ATP binding site (InterPro:IPR017441), Serine/threonine-protein kinase domain (InterPro:IPR002290), Serine/threonine-protein kinase-like domain (InterPro:IPR017442), Protein kinase-like domain (InterPro:IPR011009), Serine/threonine-protein kinase, active site (InterPro:IPR008271), Protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR000719), Calcium/calmodulin-dependent protein kinase-like (InterPro:IPR020636), Serine/threonine-protein kinase-like, plant (InterPro:IPR015740); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Protein kinase superfamily protein (TAIR:AT4G33950.1); Has 113721 Blast hits to 111945 proteins in 3588 species: Archae - 122; Bacteria - 13185; Metazoa - 42626; Fungi - 12251; Plants - 25423; Viruses - 494; Other Eukaryotes - 19620 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:-:18548704..18551056 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 39777.00 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 4.63 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.45 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 350 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MERYDILRDL GSGNFGVAKL VREKANGEFY AVKYIERGLK IDEHVQREII NHRDLKHPNI IRFKEVFVTP THLAIVMEYA AGGELFERIC NAGRFSEDEG 101: RYYFKQLISG VSYCHAMQIC HRDLKLENTL LDGSPSSHLK ICDFGYSKSS VLHSQPKSTV GTPAYVAPEV LSRKEYNGKI ADVWSCGVTL YVMLVGAYPF 201: EDPEDPRNIR NTIQRILSVH YTIPDYVRIS SECKHLLSRI FVADPDKRIT VPEIEKHPWF LKGPLVVPPE EEKCDNGVEE EEEEEEKCRQ SVEEIVKIIE 301: EARKGVNGTD NNGGLGLIDG SIDLDDIDDA DIYDDVDDDE ERNGDFVCAL |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)