AT4G39520.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : GTP-binding protein-related | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a member of the DRG (developmentally regulated G-protein) family. Has GTPase activity. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
GTP-binding protein-related; FUNCTIONS IN: GDP binding, GTP binding, GTPase activity; LOCATED IN: intracellular; EXPRESSED IN: 24 plant structures; EXPRESSED DURING: 15 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Small GTP-binding protein (InterPro:IPR005225), TGS (InterPro:IPR004095), GTP1/OBG (InterPro:IPR006073), GTP1/OBG, conserved site (InterPro:IPR006074), GTP-binding protein, HSR1-related (InterPro:IPR002917); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: developmentally regulated G-protein 1 (TAIR:AT1G17470.2); Has 19252 Blast hits to 19228 proteins in 2957 species: Archae - 773; Bacteria - 12312; Metazoa - 831; Fungi - 661; Plants - 370; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 4305 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:-:18371329..18374000 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 41146.10 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.62 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.27 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 369 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MSTIMQKIKE IEDEMAKTQK NKATSHHLGL LKAKLAKLRR DLLAPPTKGG GGGAGEGFDV TKSGDSRVGL VGFPSVGKST LLNKLTGTFS EVASYEFTTL 101: TCIPGVITYR GAKIQLLDLP GIIEGAKDGK GRGRQVISTA RTCNCILIVL DAIKPITHKR LIEKELEGFG IRLNKEPPNL TFRKKDKGGI NLTSTVAVTH 201: LDLDTVKAIC GEYRMHNADI TLRYDATADD LIDVIEGSRI YMPCIYAVNK IDSITLEELE ILDKLPHYCP VSAHLEWNLD GLLDKIWEYL DLTRIYTKPK 301: AMNPDYDDPV ILSSKKRTVE DFCIRIHKDM LKQFKYALVW GSSAKHKPQR VGKEHELEDE DVVQIVKKI |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)