AT4G38880.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : GLN phosphoribosyl pyrophosphate amidotransferase 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
GLN PHOSPHORIBOSYL PYROPHOSPHATE AMIDOTRANSFERASE 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
GLN phosphoribosyl pyrophosphate amidotransferase 3 (ASE3); FUNCTIONS IN: amidophosphoribosyltransferase activity; INVOLVED IN: purine base biosynthetic process, nucleoside metabolic process, metabolic process; LOCATED IN: chloroplast; EXPRESSED IN: 13 plant structures; EXPRESSED DURING: 10 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Glutamine amidotransferase, class-II (InterPro:IPR000583), Phosphoribosyltransferase (InterPro:IPR000836), Amidophosphoribosyl transferase (InterPro:IPR005854), Glutamine amidotransferase, type II (InterPro:IPR017932); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: GLN phosphoribosyl pyrophosphate amidotransferase 2 (TAIR:AT4G34740.1); Has 21476 Blast hits to 21464 proteins in 2887 species: Archae - 620; Bacteria - 12443; Metazoa - 408; Fungi - 374; Plants - 226; Viruses - 18; Other Eukaryotes - 7387 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:+:18134116..18135714 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 58043.80 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.33 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.01 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 532 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAFSVEEISS ILPNSLSANP RNVSQNTISP SFFKPSLKPY ASKTLISLSC RRSLSPVFSA GTYVTNVDED DKLHEECGVV GIHGDPEASR LSYLALHALQ 101: HRGQEGAGIV AANQNGLESI TGVGLVSDVF TESKLNNLPG DIAIGHVRYS TSGASMLKNV QPFIASCKLG SLAVAHNGNF VNYKQLKTKL EEMGSIFITS 201: SDTELVLHLI AKSKAKTFLL RVIDACEKLR GAYSMVFVFE DKLIAVRDPF GFRPLVMGRR SNGAVVFASE TCALDLIDAT YEREVCPGEI VVVDRNHGDS 301: SMFMISHPEQ KQCVFEHGYF SQPNSIVFGR SVYETRRMYG EILATVAPVD CDVVIAVPDS GTVAALGYAA KAGVPFQIGL LRSHYAKRTF IEPTQEIRDF 401: AVKVKLSPVR AVLEGKRVVV VDDSIVRGTT SLKIVRMLRD AGAKEVHMRI ALPPMIASCY YGVDTPRSQE LISSKMSVEA IQKHINCDSL AFLPLDSLKG 501: VYGPVESHRY CYACFTGKYP VTKTESEEAD AS |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)