AT4G38510.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:vacuole 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : ATPase, V1 complex, subunit B protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
ATPase, V1 complex, subunit B protein; FUNCTIONS IN: hydrogen ion transporting ATP synthase activity, rotational mechanism, hydrolase activity, acting on acid anhydrides, catalyzing transmembrane movement of substances, proton-transporting ATPase activity, rotational mechanism, ATP binding; INVOLVED IN: proton transport, ATP metabolic process, ATP synthesis coupled proton transport; LOCATED IN: plasma membrane, vacuole, membrane, chloroplast envelope; EXPRESSED IN: 27 plant structures; EXPRESSED DURING: 15 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: ATPase, alpha/beta subunit, nucleotide-binding domain, active site (InterPro:IPR020003), ATPase, F1/V1/A1 complex, alpha/beta subunit, C-terminal (InterPro:IPR000793), ATPase, F1/V1/A1 complex, alpha/beta subunit, N-terminal (InterPro:IPR004100), ATPase, alpha/beta subunit, nucleotide-binding domain (InterPro:IPR000194), ATPase, V1 complex, subunit B (InterPro:IPR005723); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: ATPase, V1 complex, subunit B protein (TAIR:AT1G76030.1); Has 40414 Blast hits to 39266 proteins in 9675 species: Archae - 969; Bacteria - 20976; Metazoa - 1668; Fungi - 811; Plants - 8180; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 7810 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:-:18011155..18014789 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 54308.00 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 4.78 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.27 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 487 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MGAAENNLEM EGTLEIGMEY RTVSGVAGPL VILEKVKGPK YQEIVNIRLG DGTTRRGQVL EVDGEKAVVQ VFEGTSGIDN KYTTVQFTGE VLKTPVSLDM 101: LGRIFNGSGK PIDNGPPILP EAYLDISGSS INPSERTYPE EMIQTGISTI DVMNSIARGQ KIPLFSAAGL PHNEIAAQIC RQAGLVKRLE KSDNLLEHQE 201: DDNFAIVFAA MGVNMETAQF FKRDFEENGS MERVTLFLNL ANDPTIERII TPRIALTTAE YLAYECGKHV LVILTDMSSY ADALREVSAA REEVPGRRGY 301: PGYMYTDLAT IYERAGRIEG RKGSITQIPI LTMPNDDITH PTPDLTGYIT EGQIYIDRQL HNRQIYPPIN VLPSLSRLMK SAIGEGMTRR DHSDVSNQLY 401: ANYAIGKDVQ AMKAVVGEEA LSSEDLLYLE FLDKFERKFV AQGAYDTRNI FQSLDLAWTL LRIFPRELLH RIPAKTLDQF YSRDTTN |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)