AT4G38270.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:golgi 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : galacturonosyltransferase 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a protein with putative galacturonosyltransferase activity. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
galacturonosyltransferase 3 (GAUT3); FUNCTIONS IN: polygalacturonate 4-alpha-galacturonosyltransferase activity, transferase activity, transferring glycosyl groups; INVOLVED IN: carbohydrate biosynthetic process; LOCATED IN: Golgi apparatus, plasma membrane; EXPRESSED IN: 23 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Glycosyl transferase, family 8 (InterPro:IPR002495); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: galacturonosyltransferase 1 (TAIR:AT3G61130.1); Has 1550 Blast hits to 1544 proteins in 293 species: Archae - 0; Bacteria - 563; Metazoa - 141; Fungi - 0; Plants - 820; Viruses - 2; Other Eukaryotes - 24 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:+:17938433..17941410 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 77775.50 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.64 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.44 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 680 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MTTFSTCAAF LSLVVVLHAV HVGGAILESQ APHRELKAYR PLQDNNLQEV YASSAAAVHY DPDLKDVNIV ATYSDHYGNI RLGRVKMGDL SPSWVLENPA 101: YQVSRKTKGS QLVIPRDSFQ NDTGMEDNAS HSTTNQTDES ENQFPNVDFA SPAKLKRQIL RQERRGQRTL ELIRQEKETD EQMQEAAIQK SMSFENSVIG 201: KYSIWRRDYE SPNADAILKL MRDQIIMAKA YANIAKSKNV TNLYVFLMQQ CGENKRVIGK ATSDADLPSS ALDQAKAMGH ALSLAKDELY DCHELAKKFR 301: AILQSTERKV DGLKKKGTFL IQLAAKTFPK PLHCLSLQLA ADYFILGFNE EDAVKEDVSQ KKLEDPSLYH YAIFSDNVLA TSVVVNSTVL NAKEPQRHVF 401: HIVTDKLNFG AMKMWFRINA PADATIQVEN INDFKWLNSS YCSVLRQLES ARLKEYYFKA NHPSSISAGA DNLKYRNPKY LSMLNHLRFY LPEVYPKLEK 501: ILFLDDDIVV QKDLAPLWEI DMQGKVNGAV ETCKESFHRF DKYLNFSNPK ISENFDAGAC GWAFGMNMFD LKEWRKRNIT GIYHYWQDLN EDRTLWKLGS 601: LPPGLITFYN LTYAMDRSWH VLGLGYDPAL NQTAIENAAV VHYNGNYKPW LGLAFAKYKP YWSKYVEYDN PYLRRCDINE |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)