AT4G37990.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.990 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : elicitor-activated gene 3-2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes an aromatic alcohol:NADP+ oxidoreductase whose mRNA levels are increased in response to treatment with a variety of phytopathogenic bacteria. Though similar to mannitol dehydrogenases, this enzyme does not have mannitol dehydrogenase activity. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
elicitor-activated gene 3-2 (ELI3-2); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: GroES-like (InterPro:IPR011032), Alcohol dehydrogenase GroES-like (InterPro:IPR013154), Alcohol dehydrogenase, zinc-containing, conserved site (InterPro:IPR002328), Alcohol dehydrogenase, C-terminal (InterPro:IPR013149), Alcohol dehydrogenase superfamily, zinc-containing (InterPro:IPR002085); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: elicitor-activated gene 3-1 (TAIR:AT4G37980.1); Has 39982 Blast hits to 39962 proteins in 3075 species: Archae - 828; Bacteria - 26485; Metazoa - 1263; Fungi - 3046; Plants - 3202; Viruses - 3; Other Eukaryotes - 5155 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:+:17855964..17857388 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 38944.70 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.25 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.01 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 359 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MGKVLQKEAF GLAAKDNSGV LSPFSFTRRE TGEKDVRFKV LFCGICHSDL HMVKNEWGMS TYPLVPGHEI VGVVTEVGAK VTKFKTGEKV GVGCLVSSCG 101: SCDSCTEGME NYCPKSIQTY GFPYYDNTIT YGGYSDHMVC EEGFVIRIPD NLPLDAAAPL LCAGITVYSP MKYHGLDKPG MHIGVVGLGG LGHVGVKFAK 201: AMGTKVTVIS TSEKKRDEAI NRLGADAFLV SRDPKQIKDA MGTMDGIIDT VSATHSLLPL LGLLKHKGKL VMVGAPEKPL ELPVMPLIFE RKMVMGSMIG 301: GIKETQEMID MAGKHNITAD IELISADYVN TAMERLEKAD VRYRFVIDVA NTLKPNPNL |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)