AT4G37610.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 1.000 ASURE: cytosol What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : BTB and TAZ domain protein 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
BTB and TAZ domain protein. Located in cytoplasm and expressed in fruit, flower and leaves. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
BTB and TAZ domain protein 5 (BT5); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: BTB/POZ (InterPro:IPR013069), Zinc finger, TAZ-type (InterPro:IPR000197), BTB/POZ fold (InterPro:IPR011333), Kelch related (InterPro:IPR013089), BTB/POZ-like (InterPro:IPR000210); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: BTB and TAZ domain protein 4 (TAIR:AT5G67480.2); Has 30201 Blast hits to 17322 proteins in 780 species: Archae - 12; Bacteria - 1396; Metazoa - 17338; Fungi - 3422; Plants - 5037; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2996 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:-:17670606..17671992 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 42316.50 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.65 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.39 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 368 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MENMDDFSPE NVLAPPPPPP PMKKSTDLFM QRSNSFVSKA TRDSWDRMFD EAHGADVLIH TDDNGLIYAH SNVIGMASDV IRGMMKQHKR KSHRKSISIL 101: GVPHHALRVF IRFLYSSCYE KQDMEDFAIH LLVLSHVYVV PHLKRVCESE FESSLLNKEN VIDVFQLALL CDAPRLGLLC HRMILNNFEE VSTSEGWQAM 201: KESHPRLQKE LLRSVAYELN SLKQRNRKQK EIQTYTQLYE AMEAFVHICR DGCREIGPTK TETPHMSCGF QACNGLEQLL KHLAGCKLRS IPGGCSRCKR 301: MWQLLELHSR ICVDSEQCKV PLCSSLKERM KTQSRKDEKR WKLLVRNVLS TKRIGGSPFF LQAIDVTL |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)