AT4G36420.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 1.000 ASURE: mitochondrion What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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| FP Images |
Arabidopsis cell culture (mitochondrial marker)
Arabidopsis cell culture (plastidal marker)
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Ribosomal protein L12 family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Ribosomal protein L12 family protein; FUNCTIONS IN: structural constituent of ribosome; INVOLVED IN: translation; LOCATED IN: ribosome, intracellular, large ribosomal subunit; EXPRESSED IN: 21 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Ribosomal protein L7/L12 (InterPro:IPR000206), Ribosomal protein L12, chloroplast (InterPro:IPR015608), Ribosomal protein L7/L12, oligomerisation (InterPro:IPR008932), Ribosomal protein L7/L12, C-terminal/adaptor protein ClpS-like (InterPro:IPR014719), Ribosomal protein L7/L12, C-terminal (InterPro:IPR013823); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Ribosomal protein L7/L12, oligomerisation;Ribosomal protein L7/L12, C-terminal/adaptor protein ClpS-like (TAIR:AT1G70190.2); Has 8419 Blast hits to 8419 proteins in 2735 species: Archae - 0; Bacteria - 5617; Metazoa - 196; Fungi - 132; Plants - 254; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2220 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:-:17203718..17204257 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 19514.00 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 10.34 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.22 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 179 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MRNLRIISSH FSRVLKSTET RSSSVQLFTI QSRSYSSPAT QSENVSKIVN ELSNLTLLET MDLTEILRQK LNISELPVMA AMMPGMSLPG SGASKSAGGE 101: GKEKKKEAKT AFDVMLQAYD AVSKIKVIKE VRTITALGLK EAKDLVEKAP TLLKKGVSKE EAEKIIEKLK AVGAKVAME |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)