AT4G35970.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:peroxisome 1.000 ASURE: peroxisome What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : ascorbate peroxidase 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a microsomal ascorbate peroxidase APX5. Ascorbate peroxidases are enzymes that scavenge hydrogen peroxide in plant cells. Eight types of APX have been described for Arabidopsis: three cytosolic (APX1, APX2, APX6), two chloroplastic types (stromal sAPX, thylakoid tAPX), and three microsomal (APX3, APX4, APX5) isoforms. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
ascorbate peroxidase 5 (APX5); FUNCTIONS IN: L-ascorbate peroxidase activity, peroxidase activity, heme binding; INVOLVED IN: oxidation reduction, response to oxidative stress; LOCATED IN: cellular_component unknown; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Haem peroxidase (InterPro:IPR010255), Plant ascorbate peroxidase (InterPro:IPR002207), Peroxidases heam-ligand binding site (InterPro:IPR019793), Peroxidase, active site (InterPro:IPR019794), Haem peroxidase, plant/fungal/bacterial (InterPro:IPR002016); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: ascorbate peroxidase 3 (TAIR:AT4G35000.1); Has 11368 Blast hits to 9243 proteins in 1286 species: Archae - 103; Bacteria - 4136; Metazoa - 9; Fungi - 795; Plants - 3885; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2440 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:+:17028651..17030205 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 30897.00 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.02 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.40 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 279 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAVNVDAEYL KEIEKTRRDL RALISSRNCA PIMLRLAWHD AGTYDAKKKT GGANGSIRFK EELNRPHNKG LEKAVAFCEE VKAKHPRVSY ADLYQLAGVV 101: AVEVTGGPAI PFTPGRKDAD SADDGELPNP NEGASHLRTL FSRMGLLDRD IVALSGGHTL GRAHKERSDF EGPWTQDPLK FDNSYFVELL KGETPGLLQL 201: KTDKALLDDP KFHPFVKLYA KDEDMFFKAY AISHKKLSEL GFNPPRRIPS AVTQQTLGIA VAAAVVIFTI CYEASRRGK |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)