AT4G35630.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 ASURE: plastid What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : phosphoserine aminotransferase | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a phosphoserine aminotransferase which is involved in serine biosynthesis in the chloroplast which operates via the phosphorylated pathway. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
phosphoserine aminotransferase (PSAT); FUNCTIONS IN: O-phospho-L-serine:2-oxoglutarate aminotransferase activity; INVOLVED IN: L-serine biosynthetic process; LOCATED IN: chloroplast stroma, chloroplast; EXPRESSED IN: 23 plant structures; EXPRESSED DURING: 14 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Aminotransferase class-V pyridoxal-phosphate binding site (InterPro:IPR020578), Pyridoxal phosphate-dependent transferase, major domain (InterPro:IPR015424), Aminotransferase, class V/Cysteine desulfurase (InterPro:IPR000192), Phosphoserine aminotransferase, subgroup (InterPro:IPR003248), Pyridoxal phosphate-dependent transferase, major region, subdomain 1 (InterPro:IPR015421), Pyridoxal phosphate-dependent transferase, major region, subdomain 2 (InterPro:IPR015422), Phosphoserine aminotransferase (InterPro:IPR022278); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Pyridoxal phosphate (PLP)-dependent transferases superfamily protein (TAIR:AT2G17630.1); Has 1807 Blast hits to 1807 proteins in 277 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 736; Fungi - 347; Plants - 385; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 339 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:+:16904205..16905497 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 47361.90 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.19 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.23 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 430 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAATTNSFLV GSNNTQIPAL KPKSSSQSFL HLSKPNTVNF VSKTKPVAVR CVASTTQVQD GVRSGSVGSQ ERVFNFAAGP ATLPENVLLK AQADLYNWRG 101: SGMSVMEMSH RGKEFLSIIQ KAESDLRQLL EIPQEYSVLF LQGGATTQFA ALPLNLCKSD DTVDFVVTGS WGDKAVKEAK KYCKTNVIWS GKSEKYTKVP 201: SFEELEQTPD AKYLHICANE TIHGVEFKDY PVPKNGFLVA DMSSNFCSKP VDVSKFGVIY GGAQKNVGPS GVTIVIIRKD LIGNAQDITP VMLDYKIHDE 301: NSSLYNTPPC FGIYMCGLVF EDLLEQGGLK EVEKKNQRKA DLLYNAIEES NGFFRCPVEK SVRSLMNVPF TLEKSELEAE FIKEAAKEKM VQLKGHRSVG 401: GMRASIYNAM PLAGVEKLVA FMKDFQAKHA |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)