AT4G34840.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.603 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Phosphorylase superfamily protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Phosphorylase superfamily protein; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Nucleoside phosphorylase (InterPro:IPR000845), Nucleoside phosphorylase, family 1 (InterPro:IPR018017); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: methylthioadenosine nucleosidase 1 (TAIR:AT4G38800.1); Has 2832 Blast hits to 2832 proteins in 1251 species: Archae - 0; Bacteria - 2704; Metazoa - 0; Fungi - 0; Plants - 81; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 47 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:+:16606299..16607748 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 27463.50 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 4.64 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.18 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 254 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MEGVMGQVEK RPISTIVFIV AMQKEAQPLI NRLRLVEEVN TPFPKEVTWI MFKGMYKDLN INIVCPGKDS TLGVESVGTV PASLVTYASI LAIQPDLIIN 101: AGTAGGFKAK GACISDVYVV STVAFHDRRI PVPVLDIYGV GMRNTFPTPN LIKELNLKVG RLSTGDSMDM SPHDEESITA NDATVKDMEG AAVAYVADIF 201: KVPTILIKGV TDIVDGNRPT SEEFLENLAA VTAKLDESLT KVIDFISGKC LSDL |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)