AT4G34030.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 1.000 ASURE: mitochondrion What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : 3-methylcrotonyl-CoA carboxylase | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
MCC-B is involved in leucine degradation in mitochondria. The active protein is a dimer of MCC-A and MCC-B. MCC-A is biotinylated whereas MCC-B is not. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
3-methylcrotonyl-CoA carboxylase (MCCB); FUNCTIONS IN: biotin carboxylase activity, cobalt ion binding, methylcrotonoyl-CoA carboxylase activity, zinc ion binding; INVOLVED IN: leucine catabolic process; LOCATED IN: mitochondrion, mitochondrial matrix; EXPRESSED IN: 23 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Acetyl-coenzyme A carboxyltransferase, N-terminal (InterPro:IPR011762), Carboxyl transferase (InterPro:IPR000022), Acetyl-coenzyme A carboxyltransferase, C-terminal (InterPro:IPR011763); Has 30201 Blast hits to 17322 proteins in 780 species: Archae - 12; Bacteria - 1396; Metazoa - 17338; Fungi - 3422; Plants - 5037; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2996 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:+:16301298..16303949 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 64016.40 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.68 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.13 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 587 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MLRILGRRVV SASKELTSIQ QWRIRPGTDS RPDPFRTFRG LQKGFCVGIL PDGVDRNSEA FSSNSIAMEG ILSELRSHIK KVLAGGGEEA VKRNRSRNKL 101: LPRERIDRLL DPGSSFLELS QLAGHELYEE PLPSGGIITG IGPIHGRICM FMANDPTVKG GTYYPITIKK HLRAQEIAAR CRLPCIYLVD SGGAYLPKQA 201: EVFPDKENFG RVFYNESVMS SDGIPQIAIV LGSCTAGGAY IPAMADESVM VKGNGTIFLA GPPLVKAATG EEVSAEDLGG ATVHCTVSGV SDYFAQDELH 301: GLAIGRNIVK NLHMAAKQGM EGTFGSKNLV YKEPLYDINE LRSIAPVDHK QQFDVRSIIA RIVDGSEFDE FKKQYGTTLV TGFARIYGQT VGIIGNNGIL 401: FNESALKGAH FIELCSQRKI PLVFLQNITG FMVGSRAEAN GIAKAGAKMV MAVSCAKVPK ITIITGASFG AGNYAMCGRA YSPDFMFIWP NARIGIMGGA 501: QAAGVLTQIE RATKKRQGIK WTEEEEEAFK KKTVDAYERE ANPYYSTARL WDDGVIDPCD TRKVLGLCLS AALNRPLEDT RFGVFRM |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)