AT4G33670.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:peroxisome 0.640 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : NAD(P)-linked oxidoreductase superfamily protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a L-galactose dehydrogenase, involved in ascorbate biosynthesis | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
NAD(P)-linked oxidoreductase superfamily protein; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Aldo/keto reductase (InterPro:IPR001395); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: NAD(P)-linked oxidoreductase superfamily protein (TAIR:AT1G60750.1); Has 28637 Blast hits to 28630 proteins in 2499 species: Archae - 653; Bacteria - 20546; Metazoa - 1049; Fungi - 1796; Plants - 827; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 3766 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:-:16169670..16171446 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 34533.60 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.44 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.03 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 319 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MTKIELRALG NTGLKVSAVG FGASPLGSVF GPVAEDDAVA TVREAFRLGI NFFDTSPYYG GTLSEKMLGK GLKALQVPRS DYIVATKCGR YKEGFDFSAE 101: RVRKSIDESL ERLQLDYVDI LHCHDIEFGS LDQIVSETIP ALQKLKQEGK TRFIGITGLP LDIFTYVLDR VPPGTVDVIL SYCHYGVNDS TLLDLLPYLK 201: SKGVGVISAS PLAMGLLTEQ GPPEWHPASP ELKSASKAAV AHCKSKGKKI TKLALQYSLA NKEISSVLVG MSSVSQVEEN VAAVTELESL GMDQETLSEV 301: EAILEPVKNL TWPSGIHQN |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)