AT4G33350.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 ASURE: plastid What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Tic22-like family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Tic22-like family protein; LOCATED IN: chloroplast, chloroplast inner membrane, chloroplast envelope; EXPRESSED IN: 23 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Chloroplast protein import component Tic22 (InterPro:IPR005692), Tic22-like (InterPro:IPR007378); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Tic22-like family protein (TAIR:AT3G23710.1); Has 113 Blast hits to 113 proteins in 40 species: Archae - 0; Bacteria - 48; Metazoa - 0; Fungi - 0; Plants - 54; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 11 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:-:16064638..16066715 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 30107.10 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.78 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.36 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 268 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MESSVKPNPF LSFSSFIHHQ CTRFSSDLSA RIEDTKRFAE TLATRRFSLP TPPPFASVSQ SKSGTPTTTL SPSLVAKALA GTSVFTVSNT NNEFVLISDP 101: TGGKSIGLLC FRQEDAEAFL AQARLRRREL KTNAKVVPIT LDQVYLLKVE GISFRFLPDP IQIKNALELK SSGNKNGFDG VPVFQSELLV VRKKNRRYCP 201: VYFSKEDIER ELSKYTRASR GDQQIMVGSL EDVLRKMEMS EKNSGWEDVI FIPPGRSYAQ HMQDLIKE |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)