AT4G32710.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 0.998 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Protein kinase superfamily protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Protein kinase superfamily protein; FUNCTIONS IN: protein serine/threonine kinase activity, protein kinase activity, kinase activity, ATP binding; INVOLVED IN: protein amino acid phosphorylation; EXPRESSED IN: 28 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein kinase, ATP binding site (InterPro:IPR017441), Serine/threonine-protein kinase domain (InterPro:IPR002290), Serine-threonine/tyrosine-protein kinase (InterPro:IPR001245), Protein kinase-like domain (InterPro:IPR011009), Serine/threonine-protein kinase, active site (InterPro:IPR008271), Protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR000719), Tyrosine-protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR020635); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: proline extensin-like receptor kinase 1 (TAIR:AT3G24550.1); Has 121602 Blast hits to 120272 proteins in 4520 species: Archae - 116; Bacteria - 14308; Metazoa - 44161; Fungi - 10677; Plants - 33872; Viruses - 404; Other Eukaryotes - 18064 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:+:15781362..15783242 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 42741.20 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.59 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.38 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 388 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MPPPIHAKYI SSGGCDTKEN NSVAKNISMP SGMFSYEELS KATGGFSEEN LLGEGGFGYV HKGVLKNGTE VAVKQLKIGS YQGEREFQAE VDTISRVHHK 101: HLVSLVGYCV NGDKRLLVYE FVPKDTLEFH LHENRGSVLE WEMRLRIAVG AAKGLAYLHE DCSPTIIHRD IKAANILLDS KFEAKVSDFG LAKFFSDTNS 201: SFTHISTRVV GTFGYMAPEY ASSGKVTDKS DVYSFGVVLL ELITGRPSIF AKDSSTNQSL VDWARPLLTK AISGESFDFL VDSRLEKNYD TTQMANMAAC 301: AAACIRQSAW LRPRMSQVVR ALEGEVALRK VEETGNSVTY SSSENPNDIT PRYGTNKRRF DTGSSDGYTS EYGVNPSQSS SEHQQVNT |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)