AT4G31810.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : ATP-dependent caseinolytic (Clp) protease/crotonase family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
ATP-dependent caseinolytic (Clp) protease/crotonase family protein; FUNCTIONS IN: 3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase activity, catalytic activity; INVOLVED IN: fatty acid beta-oxidation, metabolic process; LOCATED IN: mitochondrion; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 12 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Crotonase, core (InterPro:IPR001753); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: ATP-dependent caseinolytic (Clp) protease/crotonase family protein (TAIR:AT3G60510.1); Has 22679 Blast hits to 22670 proteins in 1880 species: Archae - 357; Bacteria - 15693; Metazoa - 1078; Fungi - 640; Plants - 575; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 4336 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:-:15387365..15390290 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 45502.30 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 4.86 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.20 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 409 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MQTVKALRRV SEPLQWVRSV SYGRRFSALP NYSASDADFE DQVLVEGKAK SRAAILNNPS SLNALSAPMV GRLKRLYESW EENPAISFVL MKGSGKTFCS 101: GADVLSLYHS INEGNTEESK LFFENLYKFV YLQGTYLKPN IAIMDGVTMG CGGGISLPGM FRVATDKTVL AHPEVQIGFH PDAGASYYLS RLPGYLGEYL 201: ALTGQKLNGV EMIACGLATH YCLNARLPLI EERIGKLLTD DPAVIEDSLA QYGDLVYPDS SSVLHKIELI DKYFGLDTVE EIIEAMENEA ANSCNEWCKK 301: TLKQIKEASP LSLKITLQSI REGRFQTLDQ CLTHEYRISI CGVSKVVSGD FCEGIRARLV DKDFAPKWDP PRLEDVSKDM VDCYFTPASE LDDSDSELKL 401: PTAQREPYF |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)