AT4G31730.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : glutamine dumper 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Glutamine dumper1 is a putative transmembrane protein. It is involved in glutamine secretion | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
glutamine dumper 1 (GDU1); FUNCTIONS IN: molecular_function unknown; INVOLVED IN: glutamine secretion, regulation of amino acid export; LOCATED IN: integral to membrane, nucleus; EXPRESSED IN: 10 plant structures; EXPRESSED DURING: F mature embryo stage, petal differentiation and expansion stage; BEST Arabidopsis thaliana protein match is: glutamine dumper 4 (TAIR:AT2G24762.1); Has 157 Blast hits to 157 proteins in 13 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 0; Fungi - 0; Plants - 157; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 0 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:+:15361207..15361683 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 17255.30 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 4.68 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.51 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 158 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MRPLSVQSKF EDVATSTSVN HHGVTPQSPW HSPVPYLFGG LAAMLGLIAF ALLILACSYW RLSSSGEEDG QNVDEEKESR SGDKAANGAY EEKFLVIMAG 101: EDLPRYLATP AMKKCTCGGH EGKMVISQEE SVAKEEEKMR EGEEEKVKDT GETTTTSH |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)