AT4G30610.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:extracellular 1.000 ASURE: extracellular What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : alpha/beta-Hydrolases superfamily protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a secreted glycosylated serine carboxypeptidase with broad substrate preference that is involved in brassinosteroid signalling via BRI1. It is proteolytically processed in vivo by a separate as yet unidentified protease. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
BRI1 SUPPRESSOR 1 (BRS1); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Peptidase S10, serine carboxypeptidase (InterPro:IPR001563), Peptidase S10, serine carboxypeptidase, active site (InterPro:IPR018202); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: serine carboxypeptidase-like 22 (TAIR:AT2G24000.1); Has 3492 Blast hits to 3440 proteins in 297 species: Archae - 0; Bacteria - 59; Metazoa - 632; Fungi - 854; Plants - 1543; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 404 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:+:14944219..14948391 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 52847.60 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.46 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.35 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 465 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MARTHFIFLL LVALLSTTFP SSSSSREQEK DRIKALPGQP KVAFSQYSGY VNVNQSHGRA LFYWLTESSS PSPHTKPLLL WLNGGPGCSS IAYGASEEIG 101: PFRINKTGSN LYLNKFAWNK DANLLFLESP AGVGYSYTNT SSDLKDSGDE RTAQDNLIFL IKWLSRFPQY KYRDFYIAGE SYAGHYVPQL AKKINDYNKA 201: FSKPIINLKG FLVGNAVTDN QYDSIGTVTY WWTHAIISDK SYKSILKYCN FTVERVSDDC DNAVNYAMNH EFGDIDQYSI YTPTCVAAQQ KKNTTGFFVR 301: MKNTLLRRRL VSGYDPCTES YAEKYFNRPD VQRAMHANVT GIRYKWTACS DVLIKTWKDS DKTMLPIYKE LAASGLRIWI FSGDTDSVVP VTATRFSLSH 401: LNLPVKTRWY PWYTDNQVGG WTEVYKGLTF ATVRGAGHEV PLFEPKRALI LFRSFLAGKE LPRSY |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)