AT4G30530.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:peroxisome 0.993 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Class I glutamine amidotransferase-like superfamily protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Class I glutamine amidotransferase-like superfamily protein; FUNCTIONS IN: catalytic activity; LOCATED IN: endomembrane system; EXPRESSED IN: 23 plant structures; EXPRESSED DURING: 14 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Glutamine amidotransferase class-I, C-terminal (InterPro:IPR000991), Glutamine amidotransferase type 1 (InterPro:IPR017926); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Class I glutamine amidotransferase-like superfamily protein (TAIR:AT2G23960.1); Has 6062 Blast hits to 6062 proteins in 1405 species: Archae - 320; Bacteria - 2958; Metazoa - 7; Fungi - 211; Plants - 100; Viruses - 3; Other Eukaryotes - 2463 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:+:14920605..14922286 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 28387.00 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.43 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.29 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 250 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MVEQKRYALF LATLDSEFVK KTYGGYHNVF VTTFGDEGEH WDSFRVVSGE FPDEKDLEKY DGFVISGSSH DAFENDDWIL KLCDIVKKID EMKKKILGIC 101: FGHQIIARVR GGTVGRAKKG PELKLGDITI VKDAITPGSY FGNEIPDSIA IIKCHQDEVL VLPETAKVLA YSKNYEVEMY SIEDHLFCIQ GHPEYNKEIL 201: FEIVDRVLAL GYVKQEFADA AKATMENRGA DRKLWETICK NFLKGRVPTN |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)