AT4G29050.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 1.000 ASURE: plasma membrane What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Concanavalin A-like lectin protein kinase family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Concanavalin A-like lectin protein kinase family protein; FUNCTIONS IN: carbohydrate binding, kinase activity; INVOLVED IN: protein amino acid phosphorylation; LOCATED IN: endomembrane system; EXPRESSED IN: 7 plant structures; EXPRESSED DURING: 8 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Legume lectin, beta chain (InterPro:IPR001220), Protein kinase, ATP binding site (InterPro:IPR017441), Serine/threonine-protein kinase-like domain (InterPro:IPR017442), Concanavalin A-like lectin/glucanase, subgroup (InterPro:IPR013320), Protein kinase-like domain (InterPro:IPR011009), Serine/threonine-protein kinase, active site (InterPro:IPR008271), Protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR000719), Concanavalin A-like lectin/glucanase (InterPro:IPR008985), Legume lectin, beta chain, Mn/Ca-binding site (InterPro:IPR019825); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Concanavalin A-like lectin protein kinase family protein (TAIR:AT1G70110.1); Has 123408 Blast hits to 121938 proteins in 4814 species: Archae - 120; Bacteria - 14220; Metazoa - 44809; Fungi - 10855; Plants - 34836; Viruses - 425; Other Eukaryotes - 18143 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:-:14314870..14316879 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 74740.60 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.27 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 669 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MKFFVLVLLL VLQFFSNKAL SQSEEGEFGF NGYLYDNSGI AITNSKGLMK LTNSSEFSYG HVFYNSPVRF KNSPNGTVSS FSTTFVFAIV SNVNALDGHG 101: LAFVISPTKG LPYSSSSQYL GLFNLTNNGD PSNHIVAVEF DTFQNQEFDD MDNNHVGIDI NSLSSEKAST AGYYEDDDGT FKNIRLINQK PIQAWIEYDS 201: SRRQLNVTIH PIHLPKPKIP LLSLTKDLSP YLFDSMYVGF TSATGRLRSS HYILGWTFKL NGTASNIDIS RLPKLPRDSR STSVKKILAI SLSLTSLAIL 301: VFLTISYMLF LKRKKLMEVL EDWEVQFGPH RFAYKDLYIA TKGFRNSELL GKGGFGKVYK GTLSTSNMDI AVKKVSHDSR QGMREFVAEI ATIGRLRHPN 401: LVRLLGYCRR KGELYLVYDC MPKGSLDKFL YHQPEQSLDW SQRFKIIKDV ASGLCYLHHQ WVQVIIHRDI KPANVLLDDS MNGKLGDFGL AKLCEHGFDP 501: QTSNVAGTFG YISPELSRTG KASTSSDVFA FGILMLEITC GRRPVLPRAS SPSEMVLTDW VLDCWEDDIL QVVDERVKQD DKYLEEQVAL VLKLGLFCSH 601: PVAAVRPSMS SVIQFLDGVA QLPNNLFDIV KARENVGAIE GFGEAAESLA EPCSVATLTF TEPFVSHGR |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)