AT4G28490.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Leucine-rich receptor-like protein kinase family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
member of Receptor kinase-like protein family | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
HAESA (HAE); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein kinase, ATP binding site (InterPro:IPR017441), Protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR000719), Leucine-rich repeat-containing N-terminal domain, type 2 (InterPro:IPR013210), Leucine-rich repeat (InterPro:IPR001611), Serine/threonine-protein kinase-like domain (InterPro:IPR017442), Protein kinase-like domain (InterPro:IPR011009), Serine/threonine-protein kinase, active site (InterPro:IPR008271); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: HAESA-like 1 (TAIR:AT1G28440.1); Has 220102 Blast hits to 139812 proteins in 4767 species: Archae - 153; Bacteria - 21531; Metazoa - 69757; Fungi - 11264; Plants - 91233; Viruses - 407; Other Eukaryotes - 25757 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:+:14077894..14080965 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 109102.00 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.80 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.02 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 999 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MLYCLILLLC LSSTYLPSLS LNQDATILRQ AKLGLSDPAQ SLSSWSDNND VTPCKWLGVS CDATSNVVSV DLSSFMLVGP FPSILCHLPS LHSLSLYNNS 101: INGSLSADDF DTCHNLISLD LSENLLVGSI PKSLPFNLPN LKFLEISGNN LSDTIPSSFG EFRKLESLNL AGNFLSGTIP ASLGNVTTLK ELKLAYNLFS 201: PSQIPSQLGN LTELQVLWLA GCNLVGPIPP SLSRLTSLVN LDLTFNQLTG SIPSWITQLK TVEQIELFNN SFSGELPESM GNMTTLKRFD ASMNKLTGKI 301: PDNLNLLNLE SLNLFENMLE GPLPESITRS KTLSELKLFN NRLTGVLPSQ LGANSPLQYV DLSYNRFSGE IPANVCGEGK LEYLILIDNS FSGEISNNLG 401: KCKSLTRVRL SNNKLSGQIP HGFWGLPRLS LLELSDNSFT GSIPKTIIGA KNLSNLRISK NRFSGSIPNE IGSLNGIIEI SGAENDFSGE IPESLVKLKQ 501: LSRLDLSKNQ LSGEIPRELR GWKNLNELNL ANNHLSGEIP KEVGILPVLN YLDLSSNQFS GEIPLELQNL KLNVLNLSYN HLSGKIPPLY ANKIYAHDFI 601: GNPGLCVDLD GLCRKITRSK NIGYVWILLT IFLLAGLVFV VGIVMFIAKC RKLRALKSST LAASKWRSFH KLHFSEHEIA DCLDEKNVIG FGSSGKVYKV 701: ELRGGEVVAV KKLNKSVKGG DDEYSSDSLN RDVFAAEVET LGTIRHKSIV RLWCCCSSGD CKLLVYEYMP NGSLADVLHG DRKGGVVLGW PERLRIALDA 801: AEGLSYLHHD CVPPIVHRDV KSSNILLDSD YGAKVADFGI AKVGQMSGSK TPEAMSGIAG SCGYIAPEYV YTLRVNEKSD IYSFGVVLLE LVTGKQPTDS 901: ELGDKDMAKW VCTALDKCGL EPVIDPKLDL KFKEEISKVI HIGLLCTSPL PLNRPSMRKV VIMLQEVSGA VPCSSPNTSK RSKTGGKLSP YYTEDLNSV |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)