AT4G28220.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 1.000 ASURE: mitochondrion What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : NAD(P)H dehydrogenase B1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
NAD(P)H dehydrogenase B1 (NDB1); FUNCTIONS IN: NADH dehydrogenase activity, disulfide oxidoreductase activity; INVOLVED IN: oxidation reduction; LOCATED IN: extrinsic to mitochondrial inner membrane; EXPRESSED IN: 24 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, class-II (InterPro:IPR000103), FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase (InterPro:IPR013027), EF-Hand 1, calcium-binding site (InterPro:IPR018247), Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, NAD-binding region (InterPro:IPR001327), EF-HAND 2 (InterPro:IPR018249); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: NAD(P)H dehydrogenase B3 (TAIR:AT4G21490.1); Has 30201 Blast hits to 17322 proteins in 780 species: Archae - 12; Bacteria - 1396; Metazoa - 17338; Fungi - 3422; Plants - 5037; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2996 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:+:13993078..13995651 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 63317.60 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.22 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 571 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MTLLSSLGRA SRSAPLASKL LLLGTLSGGS IVAYADANEE ANKKEEHKKK KVVVLGTGWA GISFLKDLDI TSYDVQVVSP QNYFAFTPLL PSVTCGTVEA 101: RSIVESVRNI TKKKNGEIEL WEADCFKIDH VNQKVHCRPV FKDDPEASQE FSLGYDYLIV AVGAQVNTFG TPGVLENCHF LKEVEDAQRI RRGVIDCFEK 201: AILPGLTEEQ RRRKLHFVIV GGGPTGVEFA AELHDFIIED ITKIYPSVKE LVKITLIQSG DHILNTFDER ISSFAEQKFT RDGIDVQTGM RVMSVTDKDI 301: TVKVKSSGEL VSIPHGLILW STGVGTRPVI SDFMEQVGQG GRRAVATNEW LQVTGCENVY AVGDCASIAQ RKILGDIANI FKAADADNSG TLTMEELEGV 401: VDDIIVRYPQ VELYLKSKHM RHINDLLADS EGNARKEVDI EAFKLALSEA DSQMKTLPAT AQVAAQQGAY LAKCFNRMEQ CKELPEGPKR FRTGGHHQFR 501: PFQYKHFGQF APLGGDQAAA ELPGDWVSAG KSAQWLWYSV YASKQVSWRT RALVVSDWTR RYIFGRDSSR I |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)