AT4G27270.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Quinone reductase family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Quinone reductase family protein; FUNCTIONS IN: oxidoreductase activity, FMN binding; INVOLVED IN: negative regulation of transcription; LOCATED IN: plasma membrane; EXPRESSED IN: 21 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Flavoprotein WrbA (InterPro:IPR010089), NADPH-dependent FMN reductase (InterPro:IPR005025), Flavodoxin/nitric oxide synthase (InterPro:IPR008254); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: flavodoxin-like quinone reductase 1 (TAIR:AT5G54500.1); Has 3487 Blast hits to 3484 proteins in 1099 species: Archae - 83; Bacteria - 2629; Metazoa - 2; Fungi - 274; Plants - 205; Viruses - 1; Other Eukaryotes - 293 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:-:13661458..13663243 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 21793.20 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.52 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.03 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 205 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MATKVYIVYY SMYGHVEKLA QEIRKGAASV DGVEAILWQV PETLQEDVLS KMSAPPKSDA PIITPNELAE ADGFIFGFPT RFGMMAAQFK AFLDATGGLW 101: RTQQLAGKPA GIFYSTGSQG GGQETTALTA ITQLVHHGMI FVPIGYTFGA GMFEMENVKG GSPYGAGTFA GDGSRQPTEL ELGQAFHQGK YIAAISKKLK 201: GPAAA |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)