AT4G26900.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : HIS HF | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
encodes a glutamine amidotransferase and cyclase, catalyzes the fifth and sixth steps of the histidine biosynthetic pathway | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
HIS HF (AT-HF); FUNCTIONS IN: imidazoleglycerol-phosphate synthase activity; INVOLVED IN: histidine biosynthetic process; LOCATED IN: chloroplast; EXPRESSED IN: 23 plant structures; EXPRESSED DURING: 14 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Imidazole glycerol phosphate synthase, subunit H (InterPro:IPR010139), Aldolase-type TIM barrel (InterPro:IPR013785), Glutamine amidotransferase class-I, C-terminal (InterPro:IPR000991), Ribulose-phosphate binding barrel (InterPro:IPR011060), Histidine biosynthesis, HisF (InterPro:IPR004651), Glutamine amidotransferase type 1 (InterPro:IPR017926), Histidine biosynthesis (InterPro:IPR006062), Imidazole glycerol phosphate synthase HisHF (InterPro:IPR014640); Has 1807 Blast hits to 1807 proteins in 277 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 736; Fungi - 347; Plants - 385; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 339 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:+:13515514..13519608 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 64196.00 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.74 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.21 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 592 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MEATAAPFSS IVSSRQNFSS SSSIRASSPA SLFLSQKSIG NVNRKFKSPR SLSVRASSTS DSVVTLLDYG AGNVRSIRNA LRHLGFSIKD VQTPGDILNA 101: DRLIFPGVGA FAPAMDVLNR TGMAEALCKY IENDRPFLGI CLGLQLLFDS SEENGPVKGL GVIPGIVGRF DASAGIRVPH IGWNALQVGK DSEILDDVGN 201: RHVYFVHSYR AIPSDENKDW ISSTCNYGES FISSIRRGNV HAVQFHPEKS GEVGLSVLRR FLHPKLPATQ KPMEGKASKL AKRVIACLDV RTNDKGDLVV 301: TKGDQYDVRE QSNENEVRNL GKPVDLAGQY YKDGADEISF LNITGFRDFP LGDLPMIQVL RQTSKNVFVP LTVGGGIRDF TDASGRYYSS LEVAAEYFRS 401: GADKISIGSD AVSAAEEFIK SGVKTGKSSL EQISRVYGNQ AVVVSIDPRR VYVNHPDDVP YKVIRVTNPG PNGEEYAWYQ CTVSGGREGR PIGAFELAKA 501: VEELGAGEIL LNCIDCDGQG KGFDIDLVKL ISDSVGIPVI ASSGAGTPDH FSEVFEKTNA SAALAAGIFH RKEVPIQSVK EHLQEERIEV RI |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)