AT4G25590.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : actin depolymerizing factor 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
actin depolymerizing factor 7 (ADF7); FUNCTIONS IN: actin binding; INVOLVED IN: biological_process unknown; LOCATED IN: intracellular; EXPRESSED IN: 8 plant structures; EXPRESSED DURING: L mature pollen stage, M germinated pollen stage, 4 anthesis, C globular stage, petal differentiation and expansion stage; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Actin-binding, cofilin/tropomyosin type (InterPro:IPR002108); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: actin depolymerizing factor 10 (TAIR:AT5G52360.1); Has 1500 Blast hits to 1497 proteins in 263 species: Archae - 0; Bacteria - 3; Metazoa - 654; Fungi - 151; Plants - 513; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 179 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:-:13059137..13060050 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 15820.80 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 4.83 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.39 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 137 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MANAASGMAV EDECKLKFLE LKSKRNYRFI IFRIDGQQVV VEKLGNPDET YDDFTASLPA NECRYAVFDF DFITDENCQK SKIFFIAWSP DSSRVRMKMV 101: YASSKDRFKR ELDGIQVELQ ATDPSEMSFD IIKSRAL |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)