AT4G24570.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 1.000 ASURE: mitochondrion What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : dicarboxylate carrier 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes one of the mitochondrial dicarboxylate carriers (DIC): DIC1 (AT2G22500), DIC2 (AT4G24570), DIC3 (AT5G09470). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
dicarboxylate carrier 2 (DIC2); FUNCTIONS IN: binding, dicarboxylic acid transmembrane transporter activity; INVOLVED IN: transport, mitochondrial transport; LOCATED IN: mitochondrial inner membrane, membrane; EXPRESSED IN: 24 plant structures; EXPRESSED DURING: 14 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Mitochondrial carrier protein (InterPro:IPR002067), Mitochondrial substrate carrier (InterPro:IPR001993), Mitochondrial substrate/solute carrier (InterPro:IPR018108); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: uncoupling protein 5 (TAIR:AT2G22500.1); Has 21371 Blast hits to 13123 proteins in 451 species: Archae - 0; Bacteria - 2; Metazoa - 8886; Fungi - 6458; Plants - 3905; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2120 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:+:12686546..12687487 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 32875.20 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 10.14 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.25 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 313 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MGVKSFVEGG IASVIAGCST HPLDLIKVRL QLHGEAPSTT TVTLLRPALA FPNSSPAAFL ETTSSVPKVG PISLGINIVK SEGAAALFSG VSATLLRQTL 101: YSTTRMGLYE VLKNKWTDPE SGKLNLSRKI GAGLVAGGIG AAVGNPADVA MVRMQADGRL PLAQRRNYAG VGDAIRSMVK GEGVTSLWRG SALTINRAMI 201: VTAAQLASYD QFKEGILENG VMNDGLGTHV VASFAAGFVA SVASNPVDVI KTRVMNMKVG AYDGAWDCAV KTVKAEGAMA LYKGFVPTVC RQGPFTVVLF 301: VTLEQVRKLL RDF |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)