AT4G23140.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 1.000 ASURE: plasma membrane What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : cysteine-rich RLK (RECEPTOR-like protein kinase) 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Arabidopsis thaliana receptor-like protein kinase. Naming convention from Chen et al 2003 (PMID 14756307) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
cysteine-rich RLK (RECEPTOR-like protein kinase) 6 (CRK6); FUNCTIONS IN: kinase activity; INVOLVED IN: protein amino acid phosphorylation; LOCATED IN: plasma membrane; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein kinase, ATP binding site (InterPro:IPR017441), Serine/threonine-protein kinase domain (InterPro:IPR002290), Protein of unknown function DUF26 (InterPro:IPR002902), Serine/threonine-protein kinase-like domain (InterPro:IPR017442), Protein kinase-like domain (InterPro:IPR011009), Serine/threonine-protein kinase, active site (InterPro:IPR008271), Protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR000719), Tyrosine-protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR020635); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: cysteine-rich RLK (RECEPTOR-like protein kinase) 8 (TAIR:AT4G23160.1); Has 30201 Blast hits to 17322 proteins in 780 species: Archae - 12; Bacteria - 1396; Metazoa - 17338; Fungi - 3422; Plants - 5037; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2996 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:+:12121397..12124037 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 74504.80 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.53 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.14 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 674 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MSSLISFNFL FLFSFLTSSF TASAQDPFYL NHYCPNTTTY SSNSTYSTNL RTLLSSLSSR NASYSTGFQN ATAGKAPDRV TGLFLCRGDV SPEVCRNCVA 101: FSVNQTLNLC PKVREAVFYY EQCILRYSHK NILSTAITNE GEFILSNTNT ISPNQKQIDG FTSFVSSTMS EAAGKAANSS RKLYTVNTEL TAYQNLYGLL 201: QCTPDLTRAD CLSCLQSSIN GMALSRIGAR LYWPSCTARY ELYPFYNESA IETPPLPPPP PPPPPRESLV STPPISSSSL PGKSGNSTVL VVAVVVLAVL 301: LFIALVGYCF LAKKKKKTFD TASASEVGDD MATADSLQLD YRTIQTATND FAESNKIGRG GFGEVYKGTF SNGKEVAVKR LSKNSRQGEA EFKTEVVVVA 401: KLQHRNLVRL LGFSLQGEER ILVYEYMPNK SLDCLLFDPT KQIQLDWMQR YNIIGGIARG ILYLHQDSRL TIIHRDLKAS NILLDADINP KIADFGMARI 501: FGLDQTQDNT SRIVGTYGYM APEYAMHGQF SMKSDVYSFG VLVLEIISGR KNSSFGESDG AQDLLTHAWR LWTNKKALDL VDPLIAENCQ NSEVVRCIHI 601: GLLCVQEDPA KRPAISTVFM MLTSNTVTLP VPRQPGFFIQ CRAVKDPLDS DQSTTTKSFP ASIDDESITD LYPR |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)