AT4G21390.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : S-locus lectin protein kinase family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
B120; FUNCTIONS IN: protein serine/threonine kinase activity, sugar binding, protein kinase activity, ATP binding; INVOLVED IN: protein amino acid phosphorylation, recognition of pollen; LOCATED IN: plasma membrane; EXPRESSED IN: 13 plant structures; EXPRESSED DURING: 8 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Curculin-like (mannose-binding) lectin (InterPro:IPR001480), PAN-2 domain (InterPro:IPR013227), Apple-like (InterPro:IPR003609), Protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR000719), S-locus glycoprotein (InterPro:IPR000858), Serine-threonine/tyrosine-protein kinase (InterPro:IPR001245), Protein kinase-like domain (InterPro:IPR011009), Serine/threonine-protein kinase, active site (InterPro:IPR008271); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: S-locus lectin protein kinase family protein (TAIR:AT1G61610.1); Has 119638 Blast hits to 117946 proteins in 4361 species: Archae - 104; Bacteria - 13356; Metazoa - 43759; Fungi - 9937; Plants - 34742; Viruses - 415; Other Eukaryotes - 17325 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:-:11394458..11397474 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 95173.50 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.85 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.24 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 849 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MRFFRKTSLY LSLFLYFFLY ESSMAANTIR RGESLRDGIN HKPLVSPQKT FELGFFSPGS STHRFLGIWY GNIEDKAVVW VANRATPISD QSGVLMISND 101: GNLVLLDGKN ITVWSSNIES STTNNNNRVV SIHDTGNFVL SETDTDRPIW ESFNHPTDTF LPQMRVRVNP QTGDNHAFVS WRSETDPSPG NYSLGVDPSG 201: APEIVLWEGN KTRKWRSGQW NSAIFTGIPN MSLLTNYLYG FKLSSPPDET GSVYFTYVPS DPSVLLRFKV LYNGTEEELR WNETLKKWTK FQSEPDSECD 301: QYNRCGKFGI CDMKGSNGIC SCIHGYEQVS VGNWSRGCRR RTPLKCERNI SVGEDEFLTL KSVKLPDFEI PEHNLVDPED CRERCLRNCS CNAYSLVGGI 401: GCMIWNQDLV DLQQFEAGGS SLHIRLADSE VGENRKTKIA VIVAVLVGVI LIGIFALLLW RFKRKKDVSG AYCGKNTDTS VVVADLTKSK ETTSAFSGSV 501: DIMIEGKAVN TSELPVFSLN AIAIATNDFC KENELGRGGF GPVYKGVLED GREIAVKRLS GKSGQGVDEF KNEIILIAKL QHRNLVRLLG CCFEGEEKML 601: VYEYMPNKSL DFFLFDETKQ ALIDWKLRFS IIEGIARGLL YLHRDSRLRI IHRDLKVSNV LLDAEMNPKI SDFGMARIFG GNQNEANTVR VVGTYGYMSP 701: EYAMEGLFSV KSDVYSFGVL LLEIVSGKRN TSLRSSEHGS LIGYAWYLYT HGRSEELVDP KIRVTCSKRE ALRCIHVAML CVQDSAAERP NMASVLLMLE 801: SDTATLAAPR QPTFTSTRRN SIDVNFALDS SQQYIVSSNE ITSTVVLGR |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)