AT4G20450.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Leucine-rich repeat protein kinase family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Leucine-rich repeat protein kinase family protein; FUNCTIONS IN: kinase activity; INVOLVED IN: protein amino acid phosphorylation; LOCATED IN: endomembrane system; EXPRESSED IN: 6 plant structures; EXPRESSED DURING: 4 anthesis, 4 leaf senescence stage, E expanded cotyledon stage; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein kinase, ATP binding site (InterPro:IPR017441), Protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR000719), Leucine-rich repeat (InterPro:IPR001611), Serine/threonine-protein kinase-like domain (InterPro:IPR017442), Protein kinase-like domain (InterPro:IPR011009), Serine/threonine-protein kinase, active site (InterPro:IPR008271); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Leucine-rich repeat protein kinase family protein (TAIR:AT2G29000.1); Has 157406 Blast hits to 121766 proteins in 4522 species: Archae - 95; Bacteria - 13354; Metazoa - 44140; Fungi - 9932; Plants - 71049; Viruses - 392; Other Eukaryotes - 18444 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:-:11024054..11029008 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 100697.00 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.44 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.30 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 898 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MEGIHKLIFL ALIWIFLITN IVDAQDQQGF ISLDCGMPRN ESSYTDESTG LNFSSDADFI SSGKSGTIKT EDSDSGVKYI KPYKQLRYFP EGARNCYNLT 101: VMQGTHYLIR AVFVYGNYDL KQRPKFDLYL GPNFWTTINL QDPSGGFYYR IWLQDGTVEE VIHMPKSNNL DICLVKTGTT TPFISSLELR PLRDDTYTTT 201: TGSLKLISRW YFRKPFPTLE SIIRHPDDVH DRLWDVYHAD EEWTDINTTT PVNTTVNAFD LPQAIISKAS IPQVASDTWS TTWSIQNPDD DVHVYLHFAE 301: IQALKPSDTR EFSILWNKNT IIRDYYSPLE FMADTVPIRT SSKCGDDGFC SLDLTRTKSS TLPPYCNAME VFGLLQLLQT ETDENDVTTL KNIQATYRIQ 401: KTNWQGDPCV PIQFIWTGLN CSNMFPSIPP RITSIDFSNF GLNGTITSDI QYLNQLQKLD LSNNNLTGKV PEFLAKMKLL TFINLSGNNL SGSIPQSLLN 501: MEKNGLITLL YNGNNLCLDP SCESETGPGN NKKKLLVPIL ASAASVGIII AVLLLVNILL LRKKKPSKAS RSSMVANKRS YTYEEVAVIT NNFERPLGEG 601: GFGVVYHGNV NDNEQVAVKV LSESSAQGYK QFKAEVDLLL RVHHINLVTL VGYCDEGQHL VLIYEYMSNG NLKQHLSGEN SRSPLSWENR LRIAAETAQG 701: LEYLHIGCKP PMIHRDIKSM NILLDNNFQA KLGDFGLSRS FPVGSETHVS TNVAGSPGYL DPEYYRTNWL TEKSDVFSFG VVLLEIITSQ PVIDQTREKS 801: HIGEWVGFKL TNGDIKNIVD PSMNGDYDSS SLWKALELAM SCVSPSSSGR PNMSQVANEL QECLLTENSR KGGRHDVDSK SSLEQSTSFG PEHIPDAR |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)