AT4G18480.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 ASURE: plastid What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases superfamily protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes the CHLI subunit of magnesium chelatase which is required for chlorophyll biosynthesis. All four cysteine residues of the protein form two disulfide bonds (Cys102-Cys193 and Cys354-Cys396) under oxidized conditions but are fully reduced by reduction. It was suggested that the redox state of CHLI is regulated in vivo by the change of the redox environment in the chloroplasts probably via the Trx system. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
CHLI1; FUNCTIONS IN: magnesium chelatase activity, ATPase activity; INVOLVED IN: chlorophyll biosynthetic process; LOCATED IN: magnesium chelatase complex, cell wall, chloroplast, chloroplast stroma; EXPRESSED IN: 24 plant structures; EXPRESSED DURING: 14 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: ATPase, AAA+ type, core (InterPro:IPR003593), Magnesium chelatase, ChlI subunit (InterPro:IPR000523), Magnesium chelatase, ATPase subunit I (InterPro:IPR011775); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: magnesium chelatase i2 (TAIR:AT5G45930.1); Has 6584 Blast hits to 6581 proteins in 1594 species: Archae - 309; Bacteria - 5009; Metazoa - 2; Fungi - 0; Plants - 206; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 1058 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:-:10201897..10203361 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 46272.60 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.39 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.22 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 424 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MASLLGTSSS AIWASPSLSS PSSKPSSSPI CFRPGKLFGS KLNAGIQIRP KKNRSRYHVS VMNVATEINS TEQVVGKFDS KKSARPVYPF AAIVGQDEMK 101: LCLLLNVIDP KIGGVMIMGD RGTGKSTTVR SLVDLLPEIN VVAGDPYNSD PIDPEFMGVE VRERVEKGEQ VPVIATKINM VDLPLGATED RVCGTIDIEK 201: ALTEGVKAFE PGLLAKANRG ILYVDEVNLL DDHLVDVLLD SAASGWNTVE REGISISHPA RFILIGSGNP EEGELRPQLL DRFGMHAQVG TVRDADLRVK 301: IVEERARFDS NPKDFRDTYK TEQDKLQDQI STARANLSSV QIDRELKVKI SRVCSELNVD GLRGDIVTNR AAKALAALKG KDRVTPDDVA TVIPNCLRHR 401: LRKDPLESID SGVLVSEKFA EIFS |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)