AT4G17510.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : ubiquitin C-terminal hydrolase 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
ubiquitin C-terminal hydrolase 3 (UCH3); FUNCTIONS IN: ubiquitin thiolesterase activity; INVOLVED IN: ubiquitin-dependent protein catabolic process; LOCATED IN: intracellular; EXPRESSED IN: 24 plant structures; EXPRESSED DURING: 15 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Peptidase C12, ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 1 (InterPro:IPR001578); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Peptidase C12, ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 1 (TAIR:AT1G65650.1); Has 1294 Blast hits to 1288 proteins in 232 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 624; Fungi - 359; Plants - 155; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 156 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:-:9767114..9768648 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 25713.60 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 4.65 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.28 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 234 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MATASESSSS KRWLPLESNP DVMNQYLWGL GLAPDEAECN DVYGLDDELL EMVPKPVLAV LFLYPITKKS EEERIEQDKE IKEKVHSDKV YFMKQTVGNA 101: CGTIGLLHAI GNITSEIKLS DGSFLDRFFK STANMTPMER AKFLENDSQI EDAHSVAVIA GDTPASEDAD THFICLACVE GELYELDGRK AGPISHGASS 201: PATLLKDATK VIKKMIEKNP GSLNFNLIAI SKRT |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)