AT4G17360.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 1.000 ASURE: mitochondrion What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Formyl transferase | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
encodes one of the two putative formyltetrahydrofolate deformylase. Located in the mitochondrion. Involved in photorespiratory tetrahydrofolate cycle. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
Formyl transferase; FUNCTIONS IN: methyltransferase activity, hydroxymethyl-, formyl- and related transferase activity, formyltetrahydrofolate deformylase activity; INVOLVED IN: tetrahydrofolate metabolic process, purine ribonucleotide biosynthetic process, biosynthetic process, photorespiration; LOCATED IN: mitochondrion; EXPRESSED IN: sperm cell; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Phosphoribosylglycinamide formyltransferase, active site (InterPro:IPR001555), Formyltetrahydrofolate deformylase (InterPro:IPR004810), Formyl transferase, N-terminal (InterPro:IPR002376); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: formyltetrahydrofolate deformylase, putative (TAIR:AT5G47435.1); Has 30201 Blast hits to 17322 proteins in 780 species: Archae - 12; Bacteria - 1396; Metazoa - 17338; Fungi - 3422; Plants - 5037; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2996 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:-:9703698..9705468 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 37298.20 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.82 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.16 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 328 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MIRRVSTTSC LSATAFRSFT KWSFKSSQFH GESLDSSVSP LLIPGFHVFH CPDVVGIVAK LSDCIAAKGG NILGYDVFVP ENKNVFYSRS EFIFDPVKWP 101: RRQMDEDFQT IAQKFSALSS VVRVPSLDPK YKIALLLSKQ DHCLVEMLHK WQDGKLPVDI TCVISNHERA PNTHVMRFLQ RHGISYHYLP TTDQNKIEEE 201: ILELVKGTDF LVLARYMQLL SGNFLKGYGK DVINIHHGLL PSFKGRNPVK QAFDAGVKLI GATTHFVTEE LDSGPIIEQM VERVSHRDNL RSFVQKSEDL 301: EKKCLMKAIK SYCELRVLPY GTQRTVVF |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)