AT4G16210.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:peroxisome 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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| FP Images |
onion epidermal cell layer (peroxisomal marker)
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : enoyl-CoA hydratase/isomerase A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
enoyl-CoA hydratase/isomerase A (ECHIA); FUNCTIONS IN: catalytic activity; INVOLVED IN: metabolic process; LOCATED IN: peroxisome; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Crotonase, core (InterPro:IPR001753); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: enoyl-CoA hydratase/isomerase D (TAIR:AT1G60550.1); Has 36619 Blast hits to 36609 proteins in 2298 species: Archae - 475; Bacteria - 23840; Metazoa - 1646; Fungi - 934; Plants - 612; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 9112 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:-:9176864..9177978 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 28820.10 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.68 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.09 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 265 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MDQTVSENLI QVKKESGGIA VITINRPKSL NSLTRAMMVD LAKAFKDMDS DESVQVVIFT GSGRSFCSGV DLTAAESVFK GDVKDPETDP VVQMERLRKP 101: IIGAINGFAI TAGFELALAC DILVASRGAK FMDTHARFGI FPSWGLSQKL SRIIGANKAR EVSLTSMPLT ADVAGKLGFV NHVVEEGEAL KKAREIAEAI 201: IKNEQGMVLR IKSVINDGLK LDLGHALTLE KERAHAYYSG MTKEQFRKMQ EFIAGRGSKK PSSKL |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)