AT4G15780.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : vesicle-associated membrane protein 724 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
member of VAMP72 Gene Family | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
vesicle-associated membrane protein 724 (VAMP724); FUNCTIONS IN: molecular_function unknown; INVOLVED IN: transport, vesicle-mediated transport; LOCATED IN: plasma membrane; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Longin (InterPro:IPR010908), Longin-like (InterPro:IPR011012), Synaptobrevin (InterPro:IPR001388); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: vesicle-associated membrane protein 726 (TAIR:AT1G04760.1); Has 2208 Blast hits to 2205 proteins in 254 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 886; Fungi - 363; Plants - 574; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 385 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:-:8980081..8981697 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 25238.70 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.15 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 222 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MGQESFIYSF VARGTMILAE YTEFTGNFPS IAAQCLQKLP SSSNSKFTYN CDHHTFNFLV EDGYAYCVVA KDSLSKQISI AFLERVKADF KKRYGGGKAS 101: TAIAKSLNKE FGPVMKEHMN YIVDHAEEIE KLIKVKAQVS EVKSIMLENI DKAIDRGENL TVLTDKTENL RSQAREYKKQ GTQVRRKLWY QNMKIKLVVL 201: GILLLLVLII WISVCHGFNC TD |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)