AT4G14790.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 1.000 ASURE: mitochondrion What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : ATP-dependent RNA helicase, mitochondrial (SUV3) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
encodes a nuclear-encoded DExH box RNA helicase, which is localized to mitochondria and whose in vitro ATPase activity is stimulated with mitochondrial RNA. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
ATSUV3; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Mitochondrial degradasome RNA helicase subunit C-terminal (InterPro:IPR022192), DNA/RNA helicase, C-terminal (InterPro:IPR001650); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: ATP-dependent RNA helicase, mitochondrial, putative (TAIR:AT5G39840.1); Has 3666 Blast hits to 3643 proteins in 672 species: Archae - 20; Bacteria - 977; Metazoa - 276; Fungi - 353; Plants - 117; Viruses - 18; Other Eukaryotes - 1905 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:-:8496351..8499829 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 63645.70 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.16 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 571 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAYSVVRLRK VSALGISRVL QADKGSLWRF HFEPEFGDLL RLGVLTRNYR KNSGSPKFDF TGTGTTSKFD FTDLTCPHTW YPIARKKKRK VILHVGPTNS 101: GKTYSALKHL EQSSSGVYCG PLRLLAWEVA KRLNKANVPC DLITGQEKDL VEGATHKAVT VEMADVTSVY DCAIIDEIQM VGCKQRGFAF TRALLGIAAD 201: ELHLCGDPAV VPLVEDILKV TGDDVEVHTY ERLSPLVPLK VPVSSVSSIK TGDCLVTFSR KDIYAYKKTI ERAGKHLCSV VYGSLPPETR TAQATRFNDE 301: TNDFDVLVAS DAIGMGLNLN ISRIIFSTLQ KYDGSETRDL TVSEIKQIAG RAGRFQSKFP IGEVTCLHKE DLPLLHSSLK SPSPILERAG LFPTFDLLSG 401: YSQAHPTHGL YQILEHFVEN AKLSSNYFIS NVEDMMKVAA IVDELPLGLQ EKYLFVVSPV DVNDEISGQG LAQFAQNFSK AGIVRLREIL APDRVKVPKT 501: PTELKELESI HKVLDLYVWL SLRLEDSFPD REVAASQKSI CNLLIEQFLE GNRLNSPARF SRYLRRQKLS E |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)