AT4G14360.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:golgi 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases superfamily protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases superfamily protein; INVOLVED IN: N-terminal protein myristoylation; LOCATED IN: Golgi apparatus; EXPRESSED IN: 24 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein of unknown function DUF248, methyltransferase putative (InterPro:IPR004159); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases superfamily protein (TAIR:AT3G23300.1); Has 30201 Blast hits to 17322 proteins in 780 species: Archae - 12; Bacteria - 1396; Metazoa - 17338; Fungi - 3422; Plants - 5037; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2996 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:-:8267869..8270191 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 69240.50 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.51 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.44 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 608 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MKGRSDGGQK KRVIALVCVA AVVLVFVYLF YGSSDHRASA IEYGRKLGLG GDDDDTKQDD TSSSFGVDDG FTPRSFPVCD DRHSELIPCL DRNLIYQMRL 101: KLDLSLMEHY ERHCPPPERR FNCLIPPPNG YKVPIKWPKS RDEVWKVNIP HTHLAHEKSD QNWMVVKGDK INFPGGGTHF HYGADKYIAS MANMLNYPNN 201: VLNNGGRLRT VFDVGCGVAS FGGYLLSSDI LTMSLAPNDV HQNQIQFALE RGIPASLGVL GTKRLPYPSR SFELSHCSRC RIDWLQRDGI LLLELDRVLR 301: PGGYFAYSSP EAYAQDEEDL RIWREMSALV ERMCWKIAAK RNQTVIWQKP LTNDCYLERE PGTQPPLCRS DNDPDAVWGV NMEACITSYS DHDHKTKGSG 401: LAPWPARLTS PPPRLADFGY STGMFEKDTE LWRQRVDTYW DLLSPRIESD TVRNIMDMKA SMGSFAAALK EKDVWVMNVV PEDGPNTLKL IYDRGLMGAV 501: HSWCEAFSTY PRTYDLLHAW DIISDIKKKG CSEVDLLLEM DRILRPSGFI IIRDKQRVVD FVKKYLKALH WEEVGTKTDS DSDQDSDNVV FIVQKKLWLT 601: SESLRDME |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)