AT4G14150.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : phragmoplast-associated kinesin-related protein 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Microtubule motor kinesin PAKRP1/Kinesin-12A. Together with PAKRP1L/Kinesin-12B, serve as linkers of the plus ends of antiparallel microtubules in the phragmoplast. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
phragmoplast-associated kinesin-related protein 1 (PAKRP1); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Kinesin, motor region, conserved site (InterPro:IPR019821), Kinesin-related protein (InterPro:IPR010544), Kinesin, motor domain (InterPro:IPR001752); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: phragmoplast-associated kinesin-related protein, putative (TAIR:AT3G23670.1); Has 30201 Blast hits to 17322 proteins in 780 species: Archae - 12; Bacteria - 1396; Metazoa - 17338; Fungi - 3422; Plants - 5037; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2996 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:-:8158645..8165008 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 144640.00 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.66 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.66 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 1292 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
0001: MKKHFTLPRN AILRDGGEPH SPNPSISKSK PPRKLRSAKE NAPPLDRNTS TPDHRSMRMK NPLPPRPPPS NPLKRKLSAE TATESGFSDS GVKVIVRMKP 0101: LNKGEEGDMI VEKMSKDSLT VSGQTFTFDS IANPESTQEQ MFQLVGAPLV ENCLSGFNSS VFAYGQTGSG KTYTMWGPAN GLLEEHLCGD QRGLTPRVFE 0201: RLFARIKEEQ VKHAERQLNY QCRCSLLEIY NEQITDLLDP SQKNLMIRED VKSGVYVENL TEEYVKNLTD VSQLLIKGLG NRRTGATSVN TESSRSHCVF 0301: TCVVESRCKN VADGLSSFKT SRINLVDLAG SERQKSTGAA GERLKEAGNI NRSLSQLGNL INILAEISQT GKPRHIPYRD SRLTFLLQES LGGNAKLAMV 0401: CAVSPSQSCR SETFSTLRFA QRAKAIQNKA VVNEVMQDDV NFLRGVIHQL RDELQRMKND GNNPTNPNVA YSTAWNARRS LNLLRSFGLG HPRSLPHEDN 0501: DGDIEMEIDE AAVERLCVQV GLQSSLASEG INHDMNRVKS IHSSDGQSIE KRLPEDSDVA MEDACCHTEN HEPETVDNMR TETETGIREN QIKTHSQTLD 0601: HESSFQPLSV KDALCSSLNK SEDVSSCPDL VPQDVTSANV LIADGVDDPE HLVNSASPSL CIDPVGATPV LKSPTLSVSP TIRNSRKSLK TSELSTASQK 0701: DSEGENLVTE AADPSPATSK KMNNCSSALS TQKSKVFPVR TERLASSLHK GIKLLESYCQ STAQRRSTYR FSFKAPDSEP STSISKADAG VQTIPGADAI 0801: SEENTKEFLC CKCKCREQFD AQQMGDMPNL QLVPVDNSEV AEKSKNQVPK AVEKVLAGSI RREMALEEFC TKQASEITQL NRLVQQYKHE RECNAIIGQT 0901: REDKIIRLES LMDGVLSKED FLDEEFASLL HEHKLLKDMY QNHPEVLKTK IELERTQEEV ENFKNFYGDM GEREVLLEEI QDLKLQLQCY IDPSLKSALK 1001: TCTLLKLSYQ APPVNAIPES QDESLEKTLE QERLCWTEAE TKWISLSEEL RTELEASKAL INKQKHELEI EKRCGEELKE AMQMAMEGHA RMLEQYADLE 1101: EKHMQLLARH RRIQDGIDDV KKAAARAGVR GAESRFINAL AAEISALKVE KEKERQYLRD ENKSLQTQLR DTAEAIQAAG ELLVRLKEAE EGLTVAQKRA 1201: MDAEYEAAEA YRQIDKLKKK HENEINTLNQ LVPQSHIHNE CSTKCDQAVE PSVNASSEQQ WRDEFEPLYK KETEFSNLAE PSWFSGYDRC NI |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)