AT4G13010.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 0.648 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein; FUNCTIONS IN: oxidoreductase activity, zinc ion binding; INVOLVED IN: oxidation reduction; LOCATED IN: chloroplast thylakoid membrane, chloroplast, plasma membrane, vacuole; EXPRESSED IN: 25 plant structures; EXPRESSED DURING: 15 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: GroES-like (InterPro:IPR011032), Alcohol dehydrogenase GroES-like (InterPro:IPR013154), Alcohol dehydrogenase, C-terminal (InterPro:IPR013149), Alcohol dehydrogenase superfamily, zinc-containing (InterPro:IPR002085); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein (TAIR:AT1G23740.1); Has 34133 Blast hits to 33976 proteins in 2527 species: Archae - 549; Bacteria - 21108; Metazoa - 1143; Fungi - 3531; Plants - 1393; Viruses - 3; Other Eukaryotes - 6406 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:+:7600682..7602567 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 34438.00 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.45 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.03 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 329 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAGKLMHALQ YNSYGGGAAG LEHVQVPVPT PKSNEVCLKL EATSLNPVDW KIQKGMIRPF LPRKFPCIPA TDVAGEVVEV GSGVKNFKAG DKVVAVLSHL 101: GGGGLAEFAV ATEKLTVKRP QEVGAAEAAA LPVAGLTALQ ALTNPAGLKL DGTGKKANIL VTAASGGVGH YAVQLAKLAN AHVTATCGAR NIEFVKSLGA 201: DEVLDYKTPE GAALKSPSGK KYDAVVHCAN GIPFSVFEPN LSENGKVIDI TPGPNAMWTY AVKKITMSKK QLVPLLLIPK AENLEFMVNL VKEGKVKTVI 301: DSKHPLSKAE DAWAKSIDGH ATGKIIVEP |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)