AT4G12800.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 ASURE: plastid What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : photosystem I subunit l | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes subunit L of photosystem I reaction center. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
photosystem I subunit l (PSAL); FUNCTIONS IN: molecular_function unknown; INVOLVED IN: photosynthesis, light reaction, photosynthesis; LOCATED IN: in 7 components; EXPRESSED IN: 24 plant structures; EXPRESSED DURING: 14 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Photosystem I reaction centre, subunit XI PsaL (InterPro:IPR003757); Has 443 Blast hits to 443 proteins in 121 species: Archae - 0; Bacteria - 178; Metazoa - 0; Fungi - 0; Plants - 87; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 178 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:+:7521469..7522493 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 23052.90 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 10.34 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.31 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 219 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAASASPMAS QLRSSFSSAS LSQRLAVPKG ISGAPFGVSP TKRVSSFTVR AVKSDKTTFQ VVQPINGDPF IGSLETPVTS SPLIAWYLSN LPGYRTAVNP 101: LLRGVEVGLA HGFFLVGPFV KAGPLRNTAY AGSAGSLAAA GLVVILSMCL TIYGISSFKE GEPSIAPSLT LTGRKKQPDQ LQTADGWAKF TGGFFFGGIS 201: GVTWAYFLLY VLDLPYFVK |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)