AT4G11900.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 0.998 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : S-locus lectin protein kinase family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
S-locus lectin protein kinase family protein; FUNCTIONS IN: in 6 functions; INVOLVED IN: protein amino acid phosphorylation, recognition of pollen; LOCATED IN: endomembrane system; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Curculin-like (mannose-binding) lectin (InterPro:IPR001480), PAN-2 domain (InterPro:IPR013227), Apple-like (InterPro:IPR003609), Protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR000719), S-locus glycoprotein (InterPro:IPR000858), Serine/threonine-protein kinase-like domain (InterPro:IPR017442), Protein kinase-like domain (InterPro:IPR011009), Serine/threonine-protein kinase, active site (InterPro:IPR008271); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: S-locus lectin protein kinase family protein (TAIR:AT1G61550.1); Has 124676 Blast hits to 123050 proteins in 4525 species: Archae - 110; Bacteria - 13929; Metazoa - 45657; Fungi - 10878; Plants - 35196; Viruses - 465; Other Eukaryotes - 18441 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:-:7150241..7153542 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 95821.10 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.22 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.32 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 849 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MQICKKNVFL LYYGVLVFLS FQVSSSTDTI STNQPLSGFE TIVSSGDIFE LGLFTPTPDT YDHRNYYIGM WYRHVSPQTI VWVANRESPL GGDASTYLLK 101: ILDGNLILHD NISATRKSHT EGTSRRSPQK ISEGNLLFHE TVWSTGVNSS MSKDVQAVLF DSGNLVLRDG PNSSAAVLWQ SFDHPSDTWL PGGKIRLGSQ 201: LFTSWESLID PSPGRYSLEF DPKLHSLVTV WNRSKSYWSS GPLYDWLQSF KGFPELQGTK LSFTLNMDES YITFSVDPQS RYRLVMGVSG QFMLQVWHVD 301: LQSWRVILSQ PDNRCDVYNS CGSFGICNEN REPPPCRCVP GFKREFSQGS DDSNDYSGGC KRETYLHCYK RNDEFLPIEN MKLATDPTTA SVLTSGTFRT 401: CASRCVADCS CQAYANDGNK CLVWTKDAFN LQQLDANKGH TFFLRLASSN ISTANNRKTE HSKGKSIVLP LVLASLVATA ACFVGLYCCI SSRIRRKKKQ 501: RDEKHSRELL EGGLIDDAGE NMCYLNLHDI MVATNSFSRK KKLGEGGFGP VYKGKLPNGM EVAIKRLSKK SSQGLTEFKN EVVLIIKLQH KNLVRLLGYC 601: VEGDEKLLIY EYMSNKSLDG LLFDSLKSRE LDWETRMKIV NGTTRGLQYL HEYSRLRIIH RDLKASNILL DDEMNPKISD FGTARIFGCK QIDDSTQRIV 701: GTFGYMSPEY ALGGVISEKS DIYSFGVLLL EIISGKKATR FVHNDQKHSL IAYEWESWCE TKGVSIIDEP MCCSYSLEEA MRCIHIALLC VQDHPKDRPM 801: ISQIVYMLSN DNTLPIPKQP TFSNVLNGDQ QLDYVFSINE ATQTELEAR |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)