AT4G11640.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.958 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : serine racemase | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Serine racemase, which is a bifunctional PLP-dependent enzyme catalyzing racemization of serine and dehydration of serine to pyruvate in the same way as mammalian serine racemases. similar to mammalian serine racemases. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
serine racemase (SR); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Pyridoxal phosphate-dependent enzyme, beta subunit (InterPro:IPR001926), Serine/threonine dehydratase, pyridoxal-phosphate-binding site (InterPro:IPR000634); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: L-O-methylthreonine resistant 1 (TAIR:AT3G10050.1); Has 19715 Blast hits to 19705 proteins in 2624 species: Archae - 539; Bacteria - 13612; Metazoa - 549; Fungi - 719; Plants - 186; Viruses - 2; Other Eukaryotes - 4108 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:+:7021770..7023252 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 35070.40 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.36 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 331 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MEANREKYAA DILSIKEAHD RIKPYIHRTP VLTSESLNSI SGRSLFFKCE CLQKGGAFKF RGACNAVLSL DAEQAAKGVV THSSGNHAAA LSLAAKIQGI 101: PAYIVVPKGA PKCKVDNVIR YGGKVIWSEA TMSSREEIAS KVLQETGSVL IHPYNDGRII SGQGTIALEL LEQIQEIDAI VVPISGGGLI SGVALAAKSI 201: KPSIRIIAAE PKGADDAAQS KVAGKIITLP VTNTIADGLR ASLGDLTWPV VRDLVDDVVT LEECEIIEAM KMCYEILKVS VEPSGAIGLA AVLSNSFRNN 301: PSCRDCKNIG IVLSGGNVDL GSLWDSFKSS K |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)