AT4G11530.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : cysteine-rich RLK (RECEPTOR-like protein kinase) 34 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a cysteine-rich receptor-like protein kinase. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
cysteine-rich RLK (RECEPTOR-like protein kinase) 34 (CRK34); FUNCTIONS IN: kinase activity; INVOLVED IN: protein amino acid phosphorylation; LOCATED IN: endomembrane system; EXPRESSED IN: 10 plant structures; EXPRESSED DURING: 8 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein kinase, ATP binding site (InterPro:IPR017441), Serine/threonine-protein kinase domain (InterPro:IPR002290), Protein of unknown function DUF26 (InterPro:IPR002902), Serine-threonine/tyrosine-protein kinase (InterPro:IPR001245), Serine/threonine-protein kinase, active site (InterPro:IPR008271), Protein kinase-like domain (InterPro:IPR011009), Protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR000719), Tyrosine-protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR020635); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: cysteine-rich RLK (RECEPTOR-like protein kinase) 11 (TAIR:AT4G23190.1); Has 122564 Blast hits to 120815 proteins in 4491 species: Archae - 108; Bacteria - 14237; Metazoa - 44856; Fungi - 10002; Plants - 35209; Viruses - 437; Other Eukaryotes - 17715 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:+:6987093..6989599 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 74030.60 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.51 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 669 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MKLKISFLPT FLIFLISLDS VTAQEICFSG FFKPNSTYDL NRRQILSTLS SNVTSHNGFF NSKFGQAPNR VFINGMCIPG TKPETCSDCI KGASDKISES 101: CPNKTDAYTW PDCCMVRYSN VSFSGSLVME PSETLYHTGD IEDTGTNLTV FDRIWEELML RTITAASLSS SNGSSFGQKY FAAEVASLTT FQTMYAMMQC 201: TPDVSSKDCE FCLKTSVGDY ESCCRGKQGG AVIRPSCFVR WDLYPYAGAF ENVTFPPPPP QSLPQPPVSL IPPPVSDRAN TTIKGIIVAI VVPIIVILVS 301: LVVLLVVCRR KKSYKTTEVQ ATDEITTTHS LQFSFKTIEA ATDKFSDSNM IGRGGFGEVY RGKLSSGPEV AVKRLSKTSG QGAEEFKNEA VLVSKLQHKN 401: LVRLLGFCLE GEEKILVYEF VPNKSLDYFL FDPAKQGELD WTRRYNIIGG IARGILYLHQ DSRLTIIHRD LKASNILLDA DMNPKIADFG MARIFGVDQS 501: QANTRRIAGT FGYMSPEYAM RGHFSMKSDV YSFGVLVLEI ISGKKNSSFY NIDDSGSNLV THAWRLWRNG SPLELVDPTI GESYQSSEAT RCIHIALLCV 601: QEDPADRPLL PAIIMMLTSS TTTLHVPRAP GFCLSGRDLE QDGVEYTEST SRSIPGSIND ASITEFYPR |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)