AT4G11330.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.960 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : MAP kinase 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
MAP kinase | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
MAP kinase 5 (MPK5); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein kinase, ATP binding site (InterPro:IPR017441), JNK MAP kinase (InterPro:IPR008351), Serine/threonine-protein kinase domain (InterPro:IPR002290), Serine/threonine-protein kinase-like domain (InterPro:IPR017442), Protein kinase-like domain (InterPro:IPR011009), Serine/threonine-protein kinase, active site (InterPro:IPR008271), MAP kinase, conserved site (InterPro:IPR003527), Protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR000719); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: MAP kinase 4 (TAIR:AT4G01370.1); Has 126445 Blast hits to 124887 proteins in 4831 species: Archae - 118; Bacteria - 13666; Metazoa - 48018; Fungi - 12607; Plants - 30504; Viruses - 585; Other Eukaryotes - 20947 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:+:6892143..6893845 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 43209.70 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.78 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.25 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 376 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAKEIESATD LGDTNIKGVL VHGGRYFQYN VYGNLFEVSN KYVPPIRPIG RGAYGFVCAA VDSETHEEIA IKKIGKAFDN KVDAKRTLRE IKLLRHLEHE 101: NVVVIKDIIR PPKKEDFVDV YIVFELMDTD LHQIIRSNQS LNDDHCQYFL YQILRGLKYI HSANVLHRDL KPSNLLLNSN CDLKITDFGL ARTTSETEYM 201: TEYVVTRWYR APELLLNSSE YTSAIDVWSV GCIFAEIMTR EPLFPGKDYV HQLKLITELI GSPDGASLEF LRSANARKYV KELPKFPRQN FSARFPSMNS 301: TAIDLLEKML VFDPVKRITV EEALCYPYLS ALHDLNDEPV CSNHFSFHFE DPSSTEEEIK ELVWLESVKF NPLPSI |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)