AT4G09670.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Oxidoreductase family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Oxidoreductase family protein; FUNCTIONS IN: oxidoreductase activity, binding, catalytic activity; INVOLVED IN: oxidation reduction, metabolic process; LOCATED IN: cellular_component unknown; EXPRESSED IN: 23 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Oxidoreductase, N-terminal (InterPro:IPR000683), Oxidoreductase, C-terminal (InterPro:IPR004104), NAD(P)-binding domain (InterPro:IPR016040); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase-like family protein (TAIR:AT1G34200.1); Has 17148 Blast hits to 17147 proteins in 2160 species: Archae - 344; Bacteria - 12203; Metazoa - 250; Fungi - 605; Plants - 99; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 3647 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:-:6107382..6109049 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 39564.20 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.69 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 362 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MATETQIRIG VMGCADIARK VSRAIHLAPN ATISGVASRS LEKAKAFATA NNYPESTKIH GSYESLLEDP EIDALYVPLP TSLHVEWAIK AAEKGKHILL 101: EKPVAMNVTE FDKIVDACEA NGVQIMDGTM WVHNPRTALL KEFLSDSERF GQLKTVQSCF SFAGDEDFLK NDIRVKPGLD GLGALGDAGW YAIRATLLAN 201: NFELPKTVTA FPGAVLNEAG VILSCGASLS WEDGRTATIY CSFLANLTME ITAIGTKGTL RVHDFIIPYK ETEASFTTST KAWFNDLVTA WVSPPSEHTV 301: KTELPQEACM VREFARLVGE IKNNGAKPDG YWPSISRKTQ LVVDAVKESV DKNYQQISLS GR |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)