AT4G08620.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : sulphate transporter 1;1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a sulfate transporter. Contains STAS domain. Expressed in roots and guard cells. Up-regulated by sulfur deficiency. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
sulphate transporter 1;1 (SULTR1;1); FUNCTIONS IN: sulfate transmembrane transporter activity; INVOLVED IN: sulfate transport, selenate transport; LOCATED IN: integral to membrane, chloroplast, membrane; EXPRESSED IN: root; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Sulphate transporter (InterPro:IPR011547), Sulphate transporter/antisigma-factor antagonist STAS (InterPro:IPR002645), Sulphate anion transporter, conserved site (InterPro:IPR018045), Sulphate anion transporter (InterPro:IPR001902); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: sulfate transporter 1;2 (TAIR:AT1G78000.2); Has 9700 Blast hits to 9599 proteins in 1833 species: Archae - 33; Bacteria - 5876; Metazoa - 1170; Fungi - 420; Plants - 557; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 1644 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:+:5500480..5505982 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 70661.20 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.37 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.47 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 649 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MSGTINPPDG GGSGARNPPV VRQRVLAPPK AGLLKDIKSV VEETFFHDAP LRDFKGQTPA KKALLGIQAV FPIIGWAREY TLRKFRGDLI AGLTIASLCI 101: PQDIGYAKLA NVDPKYGLYS SFVPPLIYAG MGSSRDIAIG PVAVVSLLVG TLCQAVIDPK KNPEDYLRLV FTATFFAGIF QAGLGFLRLG FLIDFLSHAA 201: VVGFMGGAAI TIALQQLKGF LGIKTFTKKT DIVSVMHSVF KNAEHGWNWQ TIVIGASFLT FLLVTKFIGK RNRKLFWVPA IAPLISVIIS TFFVFIFRAD 301: KQGVQIVKHI DQGINPISVH KIFFSGKYFT EGIRIGGIAG MVALTEAVAI ARTFAAMKDY QIDGNKEMIA LGTMNVVGSM TSCYIATGSF SRSAVNFMAG 401: VETAVSNIVM AIVVALTLEF ITPLFKYTPN AILAAIIISA VLGLIDIDAA ILIWRIDKLD FLACMGAFLG VIFISVEIGL LIAVVISFAK ILLQVTRPRT 501: TVLGKLPNSN VYRNTLQYPD AAQIPGILII RVDSAIYFSN SNYVRERASR WVREEQENAK EYGMPAIRFV IIEMSPVTDI DTSGIHSIEE LLKSLEKQEI 601: QLILANPGPV VIEKLYASKF VEEIGEKNIF LTVGDAVAVC STEVAEQQT |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)