AT4G05190.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.500 nucleus 0.500 ASURE: cytosol,nucleus What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : kinesin 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
ATK5 encodes a kinesin protein involved in microtubule spindle morphogenesis. It acts as a minus-end directed motor as well as a plus-end tracking protein (+TIP). Localizes to mitotic spindle midzones and regions rich in growing plus-ends within phragmoplasts. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
kinesin 5 (ATK5); FUNCTIONS IN: microtubule motor activity; INVOLVED IN: spindle assembly, microtubule cytoskeleton organization; LOCATED IN: spindle microtubule, nucleus; EXPRESSED IN: 19 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Kinesin, motor region, conserved site (InterPro:IPR019821), Kinesin, motor domain (InterPro:IPR001752); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: kinesin 1 (TAIR:AT4G21270.1); Has 92441 Blast hits to 53030 proteins in 2518 species: Archae - 977; Bacteria - 10764; Metazoa - 46004; Fungi - 8189; Plants - 5583; Viruses - 252; Other Eukaryotes - 20672 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:+:2675338..2679482 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 89199.00 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.56 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.65 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 790 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MPLRNQNRAP LPSPNVKKEA LSSIPFDKRR KETQGTGRRQ VLSTVNRQDA NSDVGSTEEC GKVEFTKDEV LALLNERAKA GKFDTKGKIE QMTDIIKKLK 101: VCVRWYQQVD ETHVQDKENL SSSLQSAEKR YSDKELDAKT KEEELRATIT EMKENIESLQ EKLSKEKLSK LDAIENHRRE KDCRVVAEKL QVSLREELDK 201: VKEEKMAAKQ KVTSLEDMYK RLQEYNTSLQ QYNTKLQTDL EVAREAHTRA EKEKSSILEN LTTLRGHSKS LQDQLASSRV SQDEAVKQKD SLLMEVNNLQ 301: SELQQVRDDR DRHVVQSQKL AGEILMYKES VGKSSHELDI LIAKSGSLEE TCSLQKERIK MLEQELAFAK EKLKMVDLSM SHTMTEFEEQ KQCMHELQDR 401: LADTERQLFE GELLRKKLHN TILELKGNIR VFCRVRPLLP DDGGRQEASV IAYPTSTESL GRGIDVVQSG NKHPFTFDKV FDHGASQEEV FFEISQLVQS 501: ALDGYKVCIF AYGQTGSGKT YTMMGRPETP EQKGLIPRSL EQIFKTSQSL STQGWKYKMQ VSMLEIYNES IRDLLSTSRT IAIESVRADS STSGRQYTIT 601: HDVNGNTHVS DLTIVDVCSI GQISSLLQQA AQSRSVGKTH MNEQSSRSHF VFTLRISGVN ESTEQQVQGV LNLIDLAGSE RLSRSGATGD RLKETQAINK 701: SLSALSDVIF ALAKKEDHVP FRNSKLTYLL QPCLGGDSKT LMFVNISPDP SSTGESLCSL RFAARVNACE IGIPRRQTSA KLLDSRLSYG |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)