AT4G04840.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 0.996 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : methionine sulfoxide reductase B6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
methionine sulfoxide reductase B6 (MSRB6); FUNCTIONS IN: peptide-methionine-(S)-S-oxide reductase activity; INVOLVED IN: oxidation reduction; LOCATED IN: cytosol; EXPRESSED IN: 11 plant structures; EXPRESSED DURING: 7 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Methionine sulphoxide reductase B (InterPro:IPR002579), Mss4-like (InterPro:IPR011057); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: methionine sulfoxide reductase B9 (TAIR:AT4G21850.1); Has 8335 Blast hits to 8332 proteins in 2250 species: Archae - 76; Bacteria - 4945; Metazoa - 267; Fungi - 135; Plants - 207; Viruses - 1; Other Eukaryotes - 2704 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:+:2449659..2451302 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 17098.40 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.27 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.54 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 153 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MNTSPKMEME MKMETKAAPE AGMIKKSNEE WRTVLSPEQF KILREKSIEK RGSGEYVKLF EEGIYCCVGC GNPVYKSTTK FDSGCGWPAF FDAIPGAINR 101: TEERAGLRYE ITCTKCDGHL GHVLKNEGFP TPTDERHCVN SVALKFSSAI TSQ |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)